数十年前，忍者大陆的五大国面临统治的失衡，席卷整个大陆的第三次忍界大战因而爆发。隶属当年尚未成为第四代火影的波风凑小队的卡卡西，与凑老师和身为宇智波一族的带土，以及医疗忍者小凛一同前往神无毗桥执行任务。对于卡卡西常挂在嘴边的忍者规定，带土听在心中总是不太开心，但其实卡卡西会拘泥于规定是有原因的，带土在听了老师的解释后，决定要试着去努力了解卡卡西的内心。而晋身为上忍的卡卡西在此次任务中担任卡卡西小队的队长，他们三人将与老师分头执行任务……