那是在还没有查克拉这一概念的久远过去——在这片大地上突然出现了神树让人们困惑不已之时，大筒木辉夜从天而降。因为不知道辉夜背景的祖之国人民对她表示怀疑，可身为皇的天子却为辉夜的美貌所迷从而待她很好。可是，此时正是纷争四起的战乱年代。自称是“神树守护者”的辉夜虽渴望和平，但仍然被卷入了战争的漩涡之中。