为了防范使徒再袭，真嗣进行着 EVA 的操作训练，同时也转学到第 3 新东京市的学校就读。上课时，老师讲到第二次冲击的历史事件，可是同学们都不专心，在台下偷偷的利用电脑网络聊天。真嗣被套出是 EVA 驾驶员，在班上立刻成为受欢迎的人，但同班的铃原东治却对他大打出手，因为他的妹妹在 EVA 与第三使徒的战斗中受牵连而受伤，让内心本就纠结的男主更加纠结。同日，第四使徒来袭，真嗣将从避难所里偷偷出来观战的铃原东治与相田剑介救入插入栓，最后为了保护大家，并无视美里的撤退命令，在电池电量即将消耗完成之前，用高振动粒子刀杀死了使徒。 【真嗣的生活因为当了 EVA 的驾驶员而起了巨大的变化，但在某些方面，他亦反而受到遣责。就象许多其他剧本中的为了人类而战的主人公们，他们的存在反而被人们视为威胁一样。第四使徒是被真嗣独立消灭的，但没人会认为他是什么热血沸腾的救世主，反而，出于他消极的观念对所处环境进行的反抗，倒给人留下了深刻的印象，这种思维方式，相信很多人亦有同感吧。副标题中的 transfer 解释方式有很多，但在这里译为转校生最为合适。要表达的意义，是所处在一个陌生的集团中的那种不安感。】