在米花町郊外的一栋古老民宅里，波贺昭人与波贺明里夫妇搬了进来。受阿笠博士委托前往家居中心的柯南与少年侦探团，与波贺夫妇一见如故。得知夫妇俩正DIY翻修房屋需要帮手，便前来协助。施工过程中，夫妇俩发现墙体异常脆弱，不慎凿开墙洞后，竟露出一具白骨遗骸……!? 一直憧憬古民居的昭人，在一个半月前发现这栋房屋挂牌出售便买下了它。由于空置已久，且遗骸赤脚穿着睡衣，柯南推断白骨是前任屋主。经走访周边得知，前任住户是从事园艺工作的男性与其妻子，还有一只散养在庭院的大型犬。据悉园艺师因事故伤腿失业，常去的居酒屋也两个月未见其踪影。但居酒屋老板透露曾在邻町见过园艺师。当柯南一行人赶到邻町时，目暮警部等人已在那里等候……