放课后，小林老师神神秘秘的让同学们都离开教室，待大家午餐完毕返回教室，却发现黑板上留有一张“怪人二百面相”的字条，柯南一眼就看穿了这个江户川乱步迷老师的意图，之后，同学们又纷纷从自己的抽屉里找到了数字和筛子的图纸，柯南轻松看出暗号的所指，就在他要揭秘时却被广播叫走，解谜的重任就交给了1年B班所有同学，没有柯南的帮助，他们能否解开暗号找到老师呢？