小林老师在图书馆里发现了一个牛皮钱包，那里放了小学一年级时小兰留的字条。事情追溯到十年前，为证实谣言的真假，小兰和新一夜访校园，不想却在学校图书馆遇到了一个自称是新一弟弟的神秘男子，他向新一发出挑战并在留下了一个装有暗号的牛皮钱包后离开。于是，新一和小兰二人就在阿笠博士的帮助下展开了解谜暗号的寻宝之旅！