正在进行的推理游戏却变成了真正的杀人事件，在列车到达名古屋前柯南他们要在乘客中揪出真正的凶手来，在他们四处寻找线索的时候灰原却忍受着内心的煎熬。内心忐忑不安的灰原正在受到组织的威胁，组织的黑影已经更近一步接近灰原，她绝对不能以这种摸样被人杀害。