特别篇《龙水》衔接《石纪元》第二季结尾，第二季最后一集是出到千空等人准备出海，而本作则是出到复活了龙水，对应漫画90画。千空复活了龙水后，准备依靠龙水的能力做出能航行的大船。为了换取龙水的航海技术，千空他们要在这个史前社会挖石油，终极目标是寻找到重要的燃料——石油，以继续揭开石化光线之谜的旅途。