在霍恩海姆的策略下，成功让父亲大人的身体失去了亚美斯多利斯国民的灵魂。父亲大人为了继续保有体内的神力，开始袭击身边的人们试图藉此取得灵魂。为了消灭父亲大人体内的贤者之石，存活下来的布里克兹士兵与罗伊、阿姆斯特朗等人使出浑身的力量，不断发动攻击。但在父亲大人的反击下，阿尔失去了身体，爱德右手臂的机械铠也遭损毁。眼看父亲大人就要夺走爱德的灵魂，阿尔为了拯救哥哥而不惜做出残酷的决定。