西湖封印松动，灵隐审判会判断撒朗还会有新动作，让唐月暗中保护身怀地圣泉的莫凡。然而具有戏剧性的一幕是，唐月将保护莫凡的任务交给青天猎所。包老头想要找他的亲戚保护莫凡，却被莫凡拒绝。另一方面，莫凡也察觉到了黑教廷会针对他下毒手。（事实上，明珠学府内部的确有黑教廷人员。）当天晚上，有学生（黑教廷底层人员）对莫凡进行攻击，莫凡与之交战。几个回合下来，莫凡将他们击败。萧院长得知了莫凡可能遭受威胁的情报，之后邀请莫凡到办公室喝茶，莫凡提出要使用去三步塔修炼的资格，这使萧院长更加坚信莫凡遭遇到了黑教廷的威胁。

莫凡进入三步塔修炼，成功取得突破，事后便遭到了三步塔守卫的暗中嫉妒。黑教廷欲计划利用明珠主校区考核夺取莫凡身上的地圣泉。宇昂放出暗影妖兽的假消息设计莫凡。许昭霆却先落入黑教廷的埋伏。为救下女友张璐璐，徐昭霆被黑教廷抓走。张璐璐被随后赶来的莫凡救下。

张璐璐被莫凡送往医院，在深夜张璐璐却遭到黑畜妖偷袭，张璐璐被带到医院天台上。另一边，许昭霆惨遭黑教廷毒手，被诅咒成了宇昂手下的黑畜妖。许昭霆被宇昂带到张璐璐所在医院天台上，宇昂命令许昭霆必须亲手了结张璐璐。许昭霆眼含泪水，被迫向张璐璐动手。随后莫凡赶来，人性未泯的许昭霆向莫凡提供了黑教廷蓝衣执事的线索。许昭霆要求莫凡将他火化，莫凡含泪实现了许昭霆的要求。莫凡悲痛不已，决定先发制人。莫凡回到学校，将一滴地圣泉放在暗影妖兽体内，借此引蛇出洞，果不其然发现内鬼傅天明。莫凡对傅天明等黑教廷成员出手，众人不明真相，反而围攻莫凡。

莫凡不慎掉入宇昂的陷阱，面对诅咒畜妖的猛烈攻击，莫凡命悬一线。此时，莫凡接到唐月命令要拖住宇昂的行动。原来蓝衣执事正在冒险逗留等待宇昂。再争取一些时间，审判员夜鹰就可实施抓捕。

拉锯战后，魔法阵消失，宇昂气急败坏，下令围绞莫凡。莫凡忍无可忍，释放玫炎气焰取得了胜利，宇昂见势急忙狼狈地逃离现场。身受重伤的莫凡却遭到了众人的污蔑，好在审判员夜鹰及时出现真相大白。考核风波结束后，莫凡、赵满延等人被定为交换生，将前往燕都学府。

莫凡无意间发现小泥鳅能凝练精魄，而凝练出的精魄只能用于强化星子。明珠学府、燕都学府两校展开激烈切磋，第一场团队赛明珠学府败北，第二场紧急赶到的莫凡对战燕都学府队长穆宁雪。在莫凡看似被穆宁雪完全碾压的时候，穆宁雪却说莫凡并没有使出真本事。

莫凡战胜穆宁雪，为明珠学府赢得最终的胜利。众人开始前往金林荒城进行历练，在穿越废弃隧道时却被洞穴魔奴袭击。众人发现此隧道实质上为洞穴魔奴的老巢，众人与之展开激战。莫凡“坐收渔翁之利”，趁机收纳了无数残魄。

几个回合下来，众人已筋疲力尽。最终众人成功突围，穿过隧道后成功逃脱。历练小队狼狈抵达荒城，又因误入伪怖魔设下的藤蔓捕食陷阱，牵扯出对莫凡的积怨。莫凡离队独行，在泥鳅坠的指引下，收获了更多精魄，并将伪怖魔种子收入囊中。

大部队遭遇了绿皮大蜥的攻击，众人狼狈不堪。莫凡紧急重新加入了大部队，帮助众人摆脱了绿皮大蜥的纠缠。众人在短暂休息时却遭到了水蜘蛛的叮咬，众人均被水蜘蛛蛊惑，相互自相残杀，队伍乱成一团。莫凡和穆宁雪合力对抗蛊惑魔蛛，几个回合下来，仍然未对魔蛛造成伤筋动骨的打击，最终穆宁雪使用冰晶刹弓，消灭了魔蛛，众人的蛊惑因此被解除。而穆宁雪因无法承受使用冰晶刹弓带来的副作用而陷入昏迷。

众人伤亡惨重，已无心历练 ，一致决定原路返回。众人在折返路上却遇到陆年，本以为遇到军法师就安全的众人结果陆年却下了杀令，双方大打出手，五人当场丧命。莫凡用陆正河的性命威胁陆年，得知新系实验的真相，同时为穆宁雪争取第二次使用冰晶刹弓的时间。 分散逃命后， 莫凡一路诱敌深入，利用蜥颅巨妖威胁追敌。蜥颅巨妖的攻击猛烈，莫凡命悬一线。

在疾星狼的守护下，莫凡冲破枷锁升华了星子，使出烈拳九宫脱身。陆年俘虏了众人胁迫莫凡，斩空及时赶到与陆年开战。形势所逼，莫凡接受血利子，成功觉醒恶魔系。

友情大义当前，莫凡控制住恶魔系，救下众人。莫凡战退妖兽，现身惩治陆年。恶战结束，莫凡急需从恶魔异变之中恢复，但就连斩空也无能为力。斩空想要将恶魔莫凡带到卫部利用大量精魄尝试恢复，但恶魔莫凡最终却擅自离开，生死未卜。